Sono passati vent’anni dalla fine della Guerra dei Cyloni. Si stanno ricostruendo i mondi delle Dodici Colonie umane e i Cyloni... se ne sono rimasti fin troppo in silenzio: la razza robotica che cercò di annientare i propri creatori si è spostata in zone sconosciute dello spazio profondo.
Gli strascichi della guerra hanno portato alla creazione di una nuova, illegale professione: quella dello spazzino. Tom Zarek è uno di loro e passa al setaccio l'esterno di vecchi insediamenti alla ricerca di tecnologia Cylone di valore o di manufatti, tornando spesso a mani vuote — finché lui e l'equipaggio del Cruiser Lightning non trovano la Stazione Omega, un centro scientifico avvolto nel mistero oltre i confini dello spazio conosciuto. Eccolo lì il colpo della vita, però qualcosa va storto... la base è ancona abitata, ma non da umani: da Cyloni!
Il Battlestar Galactica, una delle navi da guerra più vecchie della flotta, riceve il segnale di soccorso del Lightning — un messaggio enigmatico composto da una sola parola: "Cyloni". William Adamo, da poco promosso Vicecomandante, è preoccupato: la maggior parte del suo equipaggio è composto da ragazzi inesperti, nuove reclute abituate perlopiù a missioni di routine e, come finirà per scoprire ben presto, il nuovo incarico è tutt'altro semplice. Omega infatti pullula di Cyloni, ma c’è anche qualcosa di più preoccupante...